一般而言，靈芝的子實體大都為一年生，大部分皆具有菌傘(蓋)和菌柄。菌蓋呈半圓形、腎形、貝殼形等、表面有同心環紋或放射狀縱紋，除樹舌類外大部分具有漆樣光澤。顏色有灰白、黃褐、紫紅、紫黑等，有時在菌蓋上因生長成熟程度之不同而同時存在數種不同顏色之區域，一般而言其生長區域位於菌蓋的最外緣，因此顏色最淡、而向內則顏色漸深。

野外辨認靈芝科的真菌主要通過以下幾個特征：細密多孔的子實層（朝下的那壹面）、菌蓋成熟後光滑堅硬的表面、以及由於菌蓋生長速度變化而形成的類似年輪的“雲紋”，如果是正在生長中的個體，還能看到菌蓋邊緣柔嫩的白色組織。

靈芝是一種木材分解菌，不需要和植物共生，這意味著它很容易人工養殖。實際上靈芝的人工養殖技術已經非常成熟，由鋸木屑、棉子殼和各類稭桿提供碳元素，由麩皮、豆粕等提供氮元素，再適量添加鈣、硫、磷、鉀等礦物質和少量微量元素。

靈芝子實體生長期間需要較潮濕的環境，當它要進行菌傘分化時,適當的光照與通氣是必要條件,如控制不當就會形成鹿角狀靈芝。

赤芝
赤芝又名丹芝，氣味苦平無毒，主治胸中結，益心氣。一般所說的靈芝為此類的代表種。主要特徵是菌傘腎形、半圓形或近圓形，表面紅褐色有漆樣光澤，有菌柄與菌傘同色或較深。

紫芝
紫芝又名木芝。甘溫無毒，主治耳聾，利關節，益精氣，堅筋骨，好顏色，療虛勞，治痔。紫芝的特徵是菌傘褐色、紫黑色至近黑色，菌肉為均勻褐色至粟褐色，其擔孢子較一般赤芝為大。

黃芝
黃芝又名金芝。甘平無毒，主治心腹五邪益脾氣，安神。根據葛洪在《抱朴子》中所描述「肉芝分為赤、白、黑、青、黃五種，黃者如紫金，大者十餘斤小者三四斤」，認為黃芝可能之一是硫黃菌，這種真菌新鮮時菌傘肉質多汁，新鮮標本常可達數斤重。

黑芝
黑芝又名玄芝。鹹平無毒，主治癃，利水道，益腎氣通九竅，聰察，具有黑色菌傘和菌柄。依《採芝圖》記載，黑芝生山谷之陰，黑蓋赤理，黑莖，味鹹苦。

青芝
青芝又名龍芝。酸平無毒，主治明目，補肝氣，安精魄。《抱朴子》云「青者如翠羽」，認為雲芝可能是青芝的代表，此種真菌亦具革質菌蓋，表面有短絨毛，因此富多樣色彩變化。

白芝
白芝又名玉芝。辛平無毒，主治咳逆上氣，益肺氣，通利囗鼻，強志安魄。《抱朴子》中描述白芝如「截肪」。這種真菌菌肉質白，如馬蹄狀，大者可數斤，生於松樹和其他針葉樹上。